Le petit détail final qui parfait une réalisation. L'avantage supplémentaire. Le comble, le bouquet (ironiquement).
Nous avons simplement ici affaire à une métaphore pâtissière, par comparaison avec ce superbe gâteau sur lequel trône, au milieu, une belle « cerise » d'un rouge parfaitement naturel, petite touche de décoration finale qui rend la pâtisserie plus appétissante (au risque, parfois, d'être cruellement déçu une fois la première bouchée avalée).
Cette expression n'est qu'une traduction exacte de l'expression anglaise « the cherry on the cake » ou de sa variante « the cherry on top » (la cerise sur le dessus, sous-entendu : du gâteau) dont le sens est on ne peut plus limpide.