L’origine de cette expression est à attribuer au conte des frères Grimm « le valeureux petit tailleur ». Le héros de ce conte se définit d'emblée comme un redoutable tueur de mouche et s’en fait gloire, alors qu'en réalité il n'en a tué que sept.
Au figuré, cette expression, appliquée aux humains, suppose au contraire, un très grand nombre de victimes, d'autant plus pathétique qu'il ne s'agit pas en réalité de mouches mais d'humains en bonne et due forme.